1981

1981年7月，廣州市社會科學研究所——廣州市社會科學院的前身，正式掛牌成立。創辦之初的社科所，只有辦公室、經濟研究室、歷史研究室、社會問題研究室和情報資料室5個機構，人員編制50名。

從1982年至1989年間，社科所先后成立了《廣州研究》（1988年改稱《開放時代》）編輯部、《廣州經濟年鑒》編輯部（1985年改稱《廣州年鑒》編輯部，代管機構）、廣州市社會科學學會聯合會（合署辦公）、城市管理研究室、太平天國研究中心（后并入歷史研究室）、科研管理處，另外還有幾個實行企業管理的經濟實體：軟科學開發服務公司、博利公共關系公司、新利堡消防工程企業有限公司和中南會計師事務所等，共14個機構。

1989

1989年8月，廣州市社會科學研究所改稱廣州市社會科學院，此時，事業編制已增至85名。

1990年至2002年，先后增設了哲學文化研究所（增掛嶺南文化研究中心牌子）、發展研究所、政治法律研究室、科技開發部（后與科研管理處合并為科研開發管理處）、機關黨委、人事處、股份經濟研究所、國際經濟社會文化研究所、金融研究所、數量經濟與技術經濟研究所，經濟研究室、歷史研究室均改稱研究所。

其間，還成立了嶺南文化研究中心、廣州市市場經濟研究發展中心、交際文化中心，創辦了《股市導報》雜志社，設立紀檢組、監察室（合署辦公）、對外學術交流處。

根據上級有關文件精神，從1998年至2000年，對院所有下屬經營性機構進行了撤銷和清理。

2003

2003年7月15日，根據市編委會、市委宣傳部、市委政策研究室、市計委《關于印發〈廣州市社會科學院與廣州市經濟研究院合并方案〉的通知》（穗編辦[2003]98號文），原廣州市社會科學院與原廣州市經濟研究院合并，組建新的廣州市社會科學院，同時撤消廣州經濟社會發展研究中心，其承擔的職能并入新的廣州市社會科學院。

根據穗編字[2006]文，社科院設立辦公室、人事處（外事處）、科研處、哲學研究所、社會學與社會政策研究所、歷史研究所、經濟研究所、區域經濟研究所、城市管理研究所、現代市場研究所、數量經濟研究所（經濟決策仿真實驗室）、金融研究所、產業經濟與企業管理研究所、國際問題研究所、軟科學研究所、政治法律研究所、出版編輯中心、文獻信息中心等18個內設機構，人員編制171個。

2008

2008年10月29日，根據市編委會《關于<珠江經濟>雜志劃歸市社科聯主管主辦問題的批復》（穗編字[2008]375號），原由市社科院所辦的《珠江經濟》雜志劃歸市社科聯主管主辦。所需6名人員編制和1名副處級領導職數從市社科院劃轉。市社科院事業編制由171名減為165名。